1、普通冻藏法：需要进行冷藏的菠菜一般是在夜晚地面上冻，中午又能化冻时采收。采收时带约1.6厘米长的根，抖净泥土，整理捆把，每捆 2公斤左右，放在阴凉处晾掉露水，并使菜体发凉，待天气转冷时冻藏。贮藏场地应选在蔽阴处，整平地面，挖宽、深各3.5厘米的若干条沟，沟间距10~15厘米，将菠菜根朝下摆放入沟，总厚度为25厘米左右。到严寒季节可在上面再加盖草苫等，保持沟内温度为-8~-5℃。
2、无通风道的菠菜冻藏法：在房屋或荫障北面的遮荫范围内，与遮荫物平行挖数条沟，沟宽25~30厘米，深度与菠菜的高度相同或稍浅，沟与沟之间的距离为20厘米左右。将经过预贮藏的菠菜捆，根向下直立摆放在沟内，将干土撒在菜捆上，土的厚度以刚把菠菜盖住为宜。以后随温度的下降，分次覆土，覆土要做到平实无缝，起到防风保湿作用。原则是菜捆中的温度尽可能保持在-4~-6℃，使菠菜呈微冻状态。
3、地上冻藏法：在收获前5~6天，把场地整平，泼一层水，以保证表土不解冻为宜。贮菜时，先撒些菜叶或树叶铺底，然后把菠菜一捆挨一捆地摆在上面，再在菜的四周用菜叶或树叶盖10~12厘米厚即可。当菠菜内部冻结时，再在上面盖10厘米厚半干的沙子，以防叶子失水。
4、袋装自发气调冷藏法：将收获后经过整理的菠菜捆成0.5~1.0公斤的菠菜把，经过散热预冷后，装入0.06~0.08毫米厚，110×80厘米规格的聚乙烯薄膜袋中，叶片相对，根朝袋两端，每袋约15~20公斤，送到冷库菜架上平放，敞口再预冷一昼夜，然后用一直径约2厘米的圆棒插入袋口扎紧，再拔出圆棒，或松扎袋口，并使袋内留有较大空隙，封袋后置入-1~1℃温度，90%~95%相对湿度的冷库中，靠袋内菠菜自发代谢活动吸氧排碳作用，可逐渐形成一个较低氧，较高二氧化碳的气体环境，同时内部湿度条件好，可保鲜2~3个月，损耗不大。
5、合畦冻藏法：选好菠菜生长健壮的地块及合畦冻藏组合，每个组合三畦，其中左一畦和右一畦为起菜畦，中间一畦为冻藏畦。冻藏前，先用铁锨把冻藏畦菠 菜全铲断根，其深度以入土1.5厘米为宜，全铲时不要弄乱菜株。同种方法把左右两畦的菠菜铲起，扣盖在中间的冻藏畦上，叶部朝下，根部向上，3个畦子的菠菜合成1畦。贮藏当天，将合畦表面用土埋严，轻拍，使菠菜上下层之间密合，防止寒风进入，气温过低时，再盖一层 7~10厘米厚的细土，利用此法可贮藏至翌年春分。
