高温季节，皮皮虾活动摄食能力差，机体的代谢水平下降，加之水体环境恶化，病原生物滋生，容易引起虾病发生。主要有应激性红体病、细菌性红体病、肠炎病、白斑病、固着类纤毛虫病、肌肉坏死病、死底症等疾病，因此，必须切实做好虾病防治工作。每隔25-30天到有检测条件的大专院校或科研院所等检测病害一次，做到无病先防、有病早治早控制。
一旦发现疾病或经检测虾已携带病毒或病菌，应及时采取控制措施。做到：定期水体消毒，预防性水体消毒一般使用二溴海因、溴氯海因等，用量0.15-0.3ppm/次，间隔10天。
治疗性水体消毒可使用复合聚维酮碘（用量0.2ppm/次）、“水毒净”（复合季铵盐、碘，用量0.15-0.3ppm/次）、二氯异氰脲酸钠（用量1 ppm/次）、二氧化氯（用量0.15-0.3ppm/次）等，间隔5-7天。
使用消毒类药剂时，应同时开动增氧机或使用增氧剂，不能同时与微生物制剂使用；保持池塘水质稳定的清新，采取多种方式增加水体溶氧（机械增氧和化学增氧等），使水体处于富氧状态（DO>6mg/l），减少皮皮虾病毒病的发病动因；定期使用免疫增强剂，提高皮皮虾自身免疫力。
可在饲料中长期添加免疫多糖（添加量为饲料量的1-3‰），高温期在饲料中可添加高稳定维生素C（添加量为饲料量的3-5‰）和大蒜素（添加量为饲料量的2%，加蛋清包裹）；可定期使用护肝保肝中草药剂，增强皮皮虾抗病能力。
比如，“三黄粉”（黄柏、黄芪、黄芩），用量为饲料的0.5%，10天拌饵一次，连用3天。皮皮虾养殖中后期，一般每3-5天必须用较密网目的旋网在池塘的四周随机抽样200-300尾皮皮虾观察是否正常。
在皮皮虾突然增料或减料，气候突变时期如下大雨、刮风后，进水、换水之后等有可以诱发虾病的情况下，要尽快用旋网抽检。
