在竹鼠规模化人工养殖中，会因为环境、饲养、温度等因素发生一些疾病，比如感冒、眼垢等疾病，面对这些竹鼠群养中容易出现的疾病，大家可采取以下防护措施：
1、感冒
原因与症状：竹鼠感冒的原因大多是病毒和霉菌、细菌的感染。潮湿环境的窝室也是很容易产生霉菌的。在季节交换之际特别容易感冒，如果竹鼠有打喷嚏、流鼻水、流泪、眼垢等现象发生，体温也比平常还高的话就是感冒了。恶化的话，还有可能导致肺炎或是呼吸困难。
治疗方法：一般的治疗方式是为患病竹鼠口服抗生素。另外感冒还没好之前，要注意竹鼠窝室的保温与温度变化的控制。
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2、眼垢
原因与症状：竹鼠通常眼睛有问题时大多会产生眼垢，或是竹鼠身体的机能出现问题时也会有眼垢发生。如果不是眼睛方面的疾病的话，那就要好好的全身检查才行了，千万不可轻忽。
治疗方法：单纯的竹鼠眼睛结膜炎只要点眼药水就可以治愈。过敏性结膜炎的话，竹鼠窝室内的垫材以及厕所内的沙就必须赶快撤除才行。
3、咬合不正
原因与症状：竹鼠的牙齿会不断的生长，所以它们必须借着咬硬的东西来把过长的牙齿给磨掉。但如果竹鼠的上下的牙齿长短不一或是咬合不正的话，就会造成无法咬东西，甚而食欲低落，嘴巴会无法完全闭上，而导致流口水。有些竹鼠患有先天的咬合不正，但大多数是因为去咬一些硬物时造成牙齿变形，或从齿根就弯曲、折断。为了避免这样的情形发生，最好放一些较硬的食物给鼠鼠磨牙用，如树枝、矿物石等。
治疗方法：将竹鼠的牙齿磨齐成适当的长度。
4、骨折与扭伤
原因与症状：造成竹鼠骨折和扭伤的原因很多，有时竹鼠的脚被绊倒而受伤引起，特别是后脚最容易发生。还有，为了让竹鼠保暖在窝室内放入一些毛巾类的东西，因为毛巾上面有很多的网孔，会很容易勾到竹鼠的脚使其受伤。另外竹鼠的爪子的长度会一直长出来，太长的话也很容易受伤。从高处落下或是和同伴之间打架也都可能会造成竹鼠的扭伤或骨折。
竹鼠骨折或扭伤的症状有下面几点：
①受伤的脚会一直抬高而无法贴在地面上，走路的时候也是一样。
②动作变得很奇怪或是变的迟钝。
③如果是伤及到脊椎的话，可能会有下半身麻痹的情形。
治疗方法：如果有竹鼠外伤出血的情况，先将伤口消毒与止血。确定是骨折的话，大多以手术的方式将细的钢钉植入。为了避免竹鼠发生骨折与扭伤，最重要的就是注意竹鼠饲养的环境。
5、肿瘤
原因与症状：竹鼠的肿瘤也是分成良性与恶性肿瘤，恶性与良性的判断并需要透过组织的切片检查来研判。竹鼠恶性的肿瘤进行摘除手术后还有可能会移转到其它部位。
治疗方法：让患病竹鼠服用抗癌药物来治疗，不过会产生反作用。如果只是单纯的化脓的肿瘤，切开后将肿瘤处清洗并消毒即可，再给予抗生素治疗。如果是良性的肿瘤的话，只要摘除后就应该可以根治了。
6、脂肪肿瘤
原因与症状：竹鼠体内的脂肪如果太多，又无法排出体外时就会发生脂肪肿瘤。预防的方法就是不要给竹鼠吃高蛋白的食物太多。
治疗方法：竹鼠脂肪肿瘤可以用手术的方式摘除，但是如果没有影响到身体的机能的话，不摘除掉是没有关系的。
7、子宫肿瘤
原因与症状：这是竹鼠母鼠才会有的疾病，也就是在子宫与卵巢处产生肿瘤。大多数的发生原因是因为感染所引起的。
治疗方法：为患病竹鼠进行子宫或是卵巢的摘除手术，并服用抗生素治疗。
8、心脏病
原因与症状：大都多是高龄的竹鼠才会有的疾病，症状是呼吸困难、食欲不振、运动能力差。用X光检查既可知道是否有心室肥大等疾病。
治疗方法：可以服用利尿剂、血管扩张剂与强心剂等，让患病竹鼠病情稳定下来。
9、淋巴球性髓膜炎
原因与症状：原因是一种叫做阿雷纳病毒所引发的，人类也有可能会被感染。竹鼠感染的症状大多为痉挛、后肢步行障碍、成长迟缓等症状。 被感染到的竹鼠会从尿液中含有这些病毒，会再传染给其它的同伴或是人类，所以要特别注意才行。
治疗方法：目前并没有治疗的方法，只能消极的避免二次感染。
10、肝病
原因与症状：因为竹鼠营养的不均衡或是病毒、细菌等原因所造成的。症状有肝机能变差、肝脏肿大、腹部有积水的现象。
治疗方法：可以透过血液来检查肝功能和肝酵素来做诊断。保持竹鼠食物营养的均衡是最好的方发。
11、便秘
便秘发病初期轻度减食、排粪减少，粪球干硬细小，常伴有高烧，病期较长时，食欲锐减、拒食，精神不振，逐渐消瘦。可灌服5-10ml植物油（菜油、花生油、菜油等）。
12、腹泻
腹泻症状为拉稀，肛门周围及后肢被稀粪污染，初时头下垂、眼无神，尾巴拖在地板上，行为迟缓。先停喂精饲料后，可内服磺胺类药，或内服土霉素。另添喂一些2-3年生竹子。
13、气胀
气胀病症状为胃部膨胀，精神不振，萎缩在笼舍内，此病常见于断奶后的仔猪。治疗可内服磺胺类药物，另促使病猪跑动，常可自己恢复。
14、食毛
食毛症症状为自咬其毛或互咬，治疗可肌注复合维生素。对外伤涂消炎膏防止发炎。
