性质不同：敌敌畏属于杀虫杀螨剂，具有触杀、胃毒和熏蒸作用，百草枯属于灭生性除草剂，具有触杀和内吸作用。
防治对象不同：敌敌畏用来防治害虫，比如咀嚼式和刺吸式口器害虫，百草枯用来防治杂草，比如各种一年生杂草和多年生杂草。
适用对象不同：敌敌畏适用于蔬菜和农田作物，百草枯适用于果园、桑园、胶园、非耕地。
一、性质不同
1、敌敌畏
是一种广谱性杀虫、杀螨剂，具有触杀、胃毒和熏蒸作用。
2、百草枯
是一种快速灭生性除草剂，也是速效触杀型灭生性联吡啶类除草剂，具有触杀作用和一定的内吸作用。
二、防治对象不同
1、敌敌畏
主要用来防治咀嚼式口器、刺吸式口器害虫，具有高效、速效、持效期短、无残留等特点。
2、百草枯
可防除各种一年生杂草，对多年生杂草有强烈的杀伤作用，但其地下茎和根能萌出新枝；对于已经木质化的棕色茎和树干无影响。
三、适用对象不同
1、敌敌畏
适用于蔬菜、果树、烟草、水稻等多种农田作物。
2、百草枯
适用于防除果园、桑园、胶园及林带的杂草，也可用于防除非耕地、田埂、路边的杂草，对于玉米、甘蔗、大豆以及苗圃等宽行作物，可采取定向喷雾防除杂草。
四、药物特点不同
1、敌敌畏
（1）代谢和降解：在室温下，敌敌畏的饱和水溶液以每天约3%的速度逐渐水解，并生成二甲基磷酸和二氯乙醛，在碱性条件下的水解速度更快。
（2）残留与蓄积：敌敌畏在自然环境中容易分解，当气温为30℃时，经过18天左右便会水解50%。
（3）迁移转化：敌敌畏的蒸气压较高，容易进入大气，进行迁移转化主要以大气和水为介质。
（4）危险特性：遇到明火、高热时会燃烧。受热时会分解，并释放出氧化磷、氯化物的毒性气体。
2、百草枯
（1）在酸性环境下较稳定，在碱性环境下会发生水解，同时在遇到紫外线的时候会分解。
（2）遇到土壤后，会迅速钝化，从而失去药效，因此百草枯对于清除土壤之中的草根和草种没有太大的作用。
（3）不具备选择性，无论是何种植物，绿色部分触之即死。
