磷肥与复合肥都有各自的优点，使用后起到的效果也不同，所以不能直接下定论表示哪个更好。
磷肥：优点为富含磷元素，使用后可增强作物茎秆的坚韧度与抗逆能力，还能促进花芽形成，加快成熟速度，提高产量和品质，缺点为在土壤中容易失效，利用率相对较低。
复合肥：优点为养分含量高，副成分少，物理性状好，便于贮存和施用，缺点为养分比例固定，而且养分的释放速度与作物需求不同步。
一、磷肥的优缺点
1、优点
（1）富含磷元素，使用后可提高作物茎秆的坚韧度，增强作物的抗寒及抗旱能力。
（2）促进花芽形成，加快成熟速度，提高产量，改善品质。
（3）对瓜类、棉花、果树使用，可促进开花结果，提高结果率。
（4）对甘蔗、甜菜、西瓜使用，可提高含糖量。
（5）对油菜使用，可增加油菜籽的含油量。
（6）对谷物使用，可加快分蘖速度，提高籽粒的饱满度。
（7）对树木使用，可增加新根的生长数量，使树体的发育情况更良好。
2、缺点
（1）在土壤中容易失效，利用率低。过度使用时，会降低土壤中的微量元素的含量。
（2）过度使用时，容易导致作物出现叶片失绿变黄等情况。
（3）过量使用磷肥时，作物的呼吸作用会大大增强，消耗体内贮存的糖分和能量，而且还会让繁殖器官提前发育，导致作物过早成熟、籽粒小、产量低。
二、复合肥的优缺点
1、优点
（1）养分含量高，低浓度复合肥，总养分含量（纯氮＋五氧化二磷＋氧化钾）达到25%以上；中浓度复合肥，总养分含量（纯氮＋五氧化二磷＋氧化钾）达到30%以上；高浓度复合肥，总养分含量（纯氮＋五氧化二磷＋氧化钾）达到40%以上。
（2）物理性状较好，颗粒较坚实、无尘，粒度大小均匀，吸湿性小，便于贮存和施用。复合肥料既适于机械化施肥，也便于人工撒施。
（3）副成分少，对土壤无不良影响，其所含养分大部分皆是作物所需，并且能够被作物吸收利用。
2、缺点
（1）养分比例固定，难以完全满足作物的需求，因为许多作物在各个生育阶段对所需养分有所差异。
（2）各种养分释放速度与作物需求不同步，各种主要养分在土壤中的移动规律也各不相同，比如氮肥的移动性大于磷、钾肥料，而后效却远不如磷、钾肥料。因此，复合肥料在养分所处位置和释放速度等方面很难完全符合作物某一时期对养分的特殊要求。
